Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnft1Q9DCN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnft1Q9DCN7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnft1Q9DCN7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnft1Q9DCN7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnft1Q9DCN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnft1Q9DCN7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft1Q9DCN7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft1Q9DCN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms