Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan4Q9DCK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms