Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabarapQ9DCD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabarapQ9DCD6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms