Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MNCb-2875Q9DCB3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MNCb-2875Q9DCB3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms