Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xrn2Q9DBR1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xrn2Q9DBR1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xrn2Q9DBR1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms