Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9DA42 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9DA42 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9DA42 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9DA42 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9DA42 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9DA42 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9DA42 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9DA42 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9DA42 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9DA42 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9DA42 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9DA42 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9DA42 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9DA42 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9DA42 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9DA42 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9DA42 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9DA42 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9DA42 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9DA42 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9DA42 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9DA42 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9DA42 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9DA42 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9DA42 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9DA42 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9DA42 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9DA42 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9DA42 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9DA42 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9DA42 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9DA42 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9DA42 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9DA42 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9DA42 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9DA42 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9DA42 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DA42 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DA42 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DA42 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9DA42 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9DA42 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9DA42 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9DA42 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9DA42 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9DA42 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9DA42 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DA42 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DA42 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DA42 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DA42 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DA42 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DA42 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DA42 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DA42 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9DA42 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9DA42 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9DA42 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9DA42 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9DA42 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9DA42 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DA42 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms