Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg7Q9D906 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg7Q9D906 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg7Q9D906 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms