Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arfgap3Q9D8S3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfgap3Q9D8S3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap3Q9D8S3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap3Q9D8S3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfgap3Q9D8S3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgap3Q9D8S3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgap3Q9D8S3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfgap3Q9D8S3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms