Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Capn9Q9D805 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn9Q9D805 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms