Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms