Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufb8Q9D6J5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufb8Q9D6J5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms