Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm5Q9D6G9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cmtm5Q9D6G9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmtm5Q9D6G9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms