Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc39Q9D5Y1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc39Q9D5Y1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc39Q9D5Y1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms