Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zcchc13Q9D548 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zcchc13Q9D548 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zcchc13Q9D548 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zcchc13Q9D548 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zcchc13Q9D548 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zcchc13Q9D548 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zcchc13Q9D548 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zcchc13Q9D548 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Zcchc13Q9D548 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zcchc13Q9D548 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zcchc13Q9D548 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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