Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl3Q9D4V7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rabl3Q9D4V7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms