Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc83Q9D4V3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms