Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ribc2Q9D4Q1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ribc2Q9D4Q1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ribc2Q9D4Q1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms