Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx29Q9D3S3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx29Q9D3S3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.1 ms