Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rufy3Q9D394 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy3Q9D394 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms