Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930583I09RikQ9D2E3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930583I09RikQ9D2E3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms