Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C2

Saal1, Protein SAAL1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saal1Q9D2C2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Saal1Q9D2C2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Saal1Q9D2C2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Saal1Q9D2C2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Saal1Q9D2C2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Saal1Q9D2C2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Saal1Q9D2C2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms