Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MrnipQ9D1F5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms