Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Susd3Q9D176 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Susd3Q9D176 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Susd3Q9D176 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms