Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88Q9D0N8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem88Q9D0N8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem88Q9D0N8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms