Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E1

Hnrnpm, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpmQ9D0E1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HnrnpmQ9D0E1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HnrnpmQ9D0E1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HnrnpmQ9D0E1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HnrnpmQ9D0E1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms