Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl3Q9CZW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl3Q9CZW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl3Q9CZW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl3Q9CZW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl3Q9CZW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl3Q9CZW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acsl3Q9CZW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Acsl3Q9CZW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms