Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610524H06RikQ9CZU9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.1 ms