Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snf8Q9CZ28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms