Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fQ9CY34 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2fQ9CY34 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms