Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mis12Q9CY25 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mis12Q9CY25 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms