Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
3100002H09RikQ9CXW6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms