Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc3Q9CW03 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms