Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CRW3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRW3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRW3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRW3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRW3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CRW3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRW3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.4 ms