Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vta1Q9CR26 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vta1Q9CR26 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vta1Q9CR26 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms