Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rer1Q9CQU3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rer1Q9CQU3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms