Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms