Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms