Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39lQ9CQD0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl39lQ9CQD0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms