Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg3Q9CPX6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 688.8 ms