Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf8Q99PV0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms