Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap4Q99P47 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap4Q99P47 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap4Q99P47 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms