Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tdrd1Q99MV1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms