Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr3Q99MB1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tlr3Q99MB1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr3Q99MB1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr3Q99MB1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr3Q99MB1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr3Q99MB1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr3Q99MB1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr3Q99MB1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr3Q99MB1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms