Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprtQ99M80 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprtQ99M80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
PtprtQ99M80 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprtQ99M80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
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