Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gins4Q99LZ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms