Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RtcbQ99LF4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RtcbQ99LF4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms