Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arrdc1Q99KN1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms