Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdelr1Q99JH8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Kdelr1Q99JH8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms