Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dhx58Q99J87 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dhx58Q99J87 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms