Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan1Q99J59 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan1Q99J59 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan1Q99J59 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan1Q99J59 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan1Q99J59 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan1Q99J59 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan1Q99J59 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan1Q99J59 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tspan1Q99J59 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tspan1Q99J59 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms